La historia comienza cuando Kagome Higurashi, una adolescente de 15 años del Japón actual (vive con su Madre, abuelo y hermano menor) se ve obligada a bajar al pozo sellado que se encuentra cerca de su casa para rescatar a Buyo, el gato de la familia que se ha caído allí. De repente un demonio ciempiés con cabeza de mujer, la arrastra a través de un portal de luz a más de 500 años atrás en el Japón feudal, más exactamente: La Era Sengoku. Allí descubre a un joven con cabellos plateados y orejas de perro clavado con una flecha al Goshinboku, el mismo árbol sagrado que permanece en su época; conoce entonces a Kaede, la sacerdotisa de la aldea quien le explica el por qué de su viaje dimensional. Kagome es la reencarnación de la hermana de Kaede, la sacerdotisa Kikyo, quien al morir fue quemada con la Shikon no Tama (perla o piedra de las 4 almas), por esto Kagome la tenia en su interior hasta que llega al Segoku y así mismo fue perseguida por demonios que deseaban la perla. También se entera de la historia de amor y traición entre Kikyo e Inuyasha, el Hanyou (mitad humano-mitad demonio) que se encuentra sellado en el árbol. Al verse indefensa, Kagome decide liberarlo arrancando la flecha que le atraviesa. Inuyasha se decide a ayudarla a pelear, no sin antes tratar de robar la perla de Shikon. El demonio pájaro logra quitarles la joya pero Kagome instintivamente (ya sabemos que es la reencarnación de una sacerdotisa) toma un arco y lanza una flecha purificadora, disolviendo al demonio pero fragmentando la Shikon no Tama en millones de pedazos que son esparcidos en diferentes direcciones por una fuerte explosión. Este suceso plantea la trama principal de la serie: encontrar y reunir los fragmentos de Shikon para completar la joya, antes de que cualquier demonio la use para sus propios fines. Dentro de los posibles demonios que desean la perla se encuentra Naraku, un verdadero malvado a pesar de ser también un Hanyou, de quien iremos descubriendo su terrible naturaleza destructiva pues se ha encargado de hacer la vida de muchos desdichada.